Hijo de Miguel Aylwin Gajardo y Laura Azócar Álvarez, y hermano del presidente Patricio Aylwin Azócar y Arturo Aylwin Azócar. Titulado como abogado por la Universidad de Chile en 1953, ejerció su profesión en el Consultorio Jurídico del Colegio de Abogados de San Bernardo, luego trabajó en el Servicio de Asistencia Judicial de Santiago y entre 1963 y 1965 fue abogado en el Consejo de Defensa del Estado. Se integró al Partido Demócrata Cristiano (PDC) en 1957, fue electo diputado durante los periodos 1965-1969, 1969-1973, 1973-1977, 1990-1994 y 1994-1998.
Durante la dictadura firmó la Declaración del Grupo de los Trece y entre enero y marzo de 1978 sufrió la relegación en la localidad de Guallatire, entonces Región de Tarapacá. Al ser liberado comenzó a ejercer un rol activo en la defensa de los derechos humanos a través de la defensa judicial de los presos políticos participando en el Comité Pro Paz y en la Vicaría de la Solidaridad. Fue presidente de la Agrupación de Abogados Pro Derechos Humanos y director de la Comisión Contra la Tortura desempeñándose como abogado querellante en casos de detenidos desaparecidos.