El 6 de mayo de 1983, durante el régimen militar de Augusto Pinochet, el Papa Juan Pablo II lo nombró arzobispo de Concepción. Tomó posesión del arzobispado el 17 de junio de 1983 para suceder a monseñor Manuel Sánchez. El 29 de junio de 1983 recibió el palio arzobispal y tuvo como obispo auxiliar a monseñor Alejandro Goic.
El período de Santos se caracterizó por sus denuncias de violaciones a los Derechos Humanos y por su enfrentamiento a la autoridad militar de la época.

Cónyuge del ejecutado político Fernando Roberto Ramírez Sánchez

Cónyuge del Detenido Desaparecido Antonio Sergio Ernesto Cabeza Quijada.

VALECH

FPMR, participo en el secuestro de Cristian Edwards.

RETTIG| Detenido Desaparecido.

Cónyuge del ejecutado político Gilberto Victoriano Veloso.

RETTIG| El 20 de diciembre de 1984 fue detenido por funcionarios de la CNI, en Santiago Sergio Fernando RUIZ LAZO, dirigente del MIR, quien había ingresado clandestinamente a Chile en los primeros días de ese mes. Sergio Ruíz anteriormente había sido detenido en el año 1975 por agentes de la DINA, y estuvo recluido en Villa Grimaldi, Cuatro Alamos y Tres Alamos. Vivió con su familia en exilio en Francia. Las autoridades habían dictado en su contra un Decreto Exento, que prohibía su ingreso al territorio nacional. No obstante que las autoridades negaron su detención, esta Comisión recibió informaciones de testigos, y otros antecedentes, que indican que la víctima fue mantenida privada de libertad en el Cuartel de la CNI de calle Borgoño, en Santiago, antes de desaparecer

Federación Luterana Mundial